Logo yang melambangkan bahwa MKKM MTs Surabaya merupakan wadah berkumpulnya Kepala Madrasah Tsanawiyah yang berkomitmen terhadap peningkatan mutu pendidikan yang berbasis agama Islam. Logo yang juga dapat menjelaskan bahwa MKKM MTs Surabaya berdiri di atas aturan-aturan organisasi yang profesional, namun mandiri, tidak mempunyai struktur organisasi yang hirarkis, birokratik dan saling ketergantungan. Logo yang bersifat terbuka dan dibentuk dengan desain modern.
Melalui proses yang cukup panjang, dimulai dengan semacam sayembara, teman-teman anggota MKKM ikut berpartisipasi mengusulkan bentuk dan desain logo. Logo-logo yang masuk ke Pengurus MKKM diseleksi dan ditawarkan di Rapat Kerja MKKM yang merupakan forum tertinggi dalam MKKM MTs Surabaya. Akhirnya, forum Reker MKKM dapat menghasilkan logo yang yang akan dipakai MKKM MTs Surabaya.
Selaku Pengurus, kami mengucapakan terima kasih yang sebesar-besarnya kepada semua pihak yang ikut berpartisipasi dalam pembuatan logo MKKM MTs Surabaya ini. Tentunya logo ini belum bersifat final, sehingga kami tetap menerima saran dan masukan dari seluruh anggota MKKM MTs Surabaya untuk diadakan perbaikan. Semoga Allah meridloi segala daya dan upaya kita semua, amin.
Arti Logo MKKM MTs Surabaya:
Sembilan (9) Bintang terdiri dari:
Sebagai panutan dan pegangan MKKM dalam berkiprah.